人类世界的每个人,都有自己的名字和身份证号,用以区分彼此。在品系众多的小鼠世界里,它们是如何命名的呢?经过基因工程修饰后的小鼠,又该如何命名呢?国标GB14923-2001哺乳动物遗传质量控制,对近交系、亚系、远交系、转基因动物等做了详细的规定,现在我们一起跟着国标的脚步和基因工程小鼠命名的实际案例,一起学习基因工程小鼠的命名。
常见的基因工程小鼠有两种修饰方式:基因定点修饰(敲入、敲除、点突变等)和随机转基因。
关于基因定点修饰,以Apoe基因敲除或条件性敲除为例,分别介绍一下每部分所代表的的含义,如下图:
该命名表示:在C57BL/6J品系上,通过靶向突变技术,对Apoe基因进行敲除/条件性敲除修饰,百奥赛图实验室首次修饰该基因。
如果该基因修饰小鼠从C56BL/6背景品系回交到另外一个近交品系BALB/c,回交代次<5代时,表示为C;B6-Apoetm1/Bcgen,每部分所代表的的含义如下图:
当回交代数≥5代时,“;”应变为“.”,具体表示为C.B6-Apoetm1/Bcgen,此处C是BALB/c的简称,B6是C57BL/6的简称,其它品系简称可查阅国标GB14923-2001。
其它情况表示方法如图表所示:
关于随机转基因,以C57BL/6J-Tg(Alb-Cre)2Bcgen为例进行介绍,每部分所代表的含义如下图:
该命名表示:在C57BL/6J品系上,通过转基因技术,转入Alb基因的启动子及Cre基因,该转基因鼠编号为2,由百奥赛图实验室制备。
通常在文章中对所用的基因工程小鼠进行表述时,可以采用简写的方式。
可以分别用加、减号上标来表示 wildtype allele与mutant allele。
如Apoe基因敲除纯合子,表示为Apoe-/-,敲除杂合子,表示为Apoe-/+,野生型对照 Apoe+/+ 或 WT (wildtype)。
敲入的元件写在上标里。
如Apoe基因敲入报告基因或Cre重组酶基因,可以写成ApoeCre/+,或者也可以直接写成Apoe-Cre。
一般直接写出表达的基因结构。
例如:Alb promoter驱动Cre表达的转基因小鼠就可以表示为Alb-Cre。
将 flox 作为上标表示,比如:Apoe 纯合子表示为 Apoeflox/flox 或 Apoef/f;Apoe 杂合子表示为 Apoeflox/+ 或Apoef/+。
如果flox 鼠与广泛表达 Cre 或生殖系表达 Cre 工具鼠交配,或与组织特异性 Cre 小鼠交配,可根据具体情况分别表示。
关于基因工程小鼠的命名知识,今天就先简单介绍到这里啦,有问题可随时咨询我们!